1963年8月9日、ニュージャージー州ニューアークで、父のジョン・ヒューストン（1920年 - 2003年）と、歌手である母のシシー・ヒューストン（1933年 - ）の3番目の子供として生まれた[8]。母・シシーは、60年代に活躍したスイート・インスピレーションズのリードボーカルで、後には、エルヴィス・プレスリーやアレサ・フランクリンのツアーにバックコーラスとしても参加している。シシーがツアーに出ている間、父親のジョンが育児を担当した。従姉には、ディオンヌ・ワーウィックやディー・ディー・ワーウィック、ジュディ・クレイなど、ゴスペルやR&B、ポップ、ソウルなど、多くのジャンルでヒットを持つ歌手がいる。ダーレン・ラヴが、ホイットニーの名付け親・代母であり、アレサ・フランクリンは、名誉伯母（honorary aunt）[注釈 1]である。